フリーソフトカシミールを使った方法です。
http://www.kashmir3d.com/

編集したいGPSログをデスクトップに保存、この時カシミールをダウンロード済みで関連付けが出来ていれば、GPSログをクリックした時点でカシミールが起動します。
関連付けが出来ていない場合、カシミールを起動、左上の(ファイル)、(各種GPSファイルを読み込む)、先ほどデスクトップに保存したGPSファイルを選択、
左上の携帯マーク？(GPSデータ編集)をクリック、(トラック)をクリック、先ほど読み込んだGPSファイルをダブルクリック、グラフが立ち上がります。
(選択範囲)の下に有るマークをクリック、するとグラフの線が水色になります。
グラフの両側にある人形のマーカーを動かして、余分な部分まで移動させます、(この時地図で場所を確認しながら)
下に有る表の水色部分をクリック、(切り取り)左上にある(上書き保存)をクリック、
念の為に先ほどの(GPSデータ編集)画面にある(トラック)をクリック先ほど切り取ったログを貼り付けて下さい、
正解の方をヤマレコにアップです。
ヤマレコにアップするにはログをクリックし(ファイルへ書き出し)GPXファイルを選択して下さい、

自分もよくGPSの電源を切り忘れるので、PCの上でカシミールを使って修正していますが、hanasaku77さんはどのような機器をお使いでしょうか。同じような機器をお使いの方の回答が分かりやすいのでは。

ちなみに、PCをお使いの場合のご参考はこちら(ちょっと長いですが、文末の注７付近)
http://www.yamareco.com/modules/diary/45037-detail-61039