救難活動の国際的な慣行では、どのような音や光、あるいは身振り手振りの合図であれ『３回繰り返し』される合図は救難要請を意味するものと認識されることになっています。これは国内でも同様です。
故に、救助活動に携わる組織の人であれば、同じ音（光）が３回繰り返しサイクルで発信されているのを見つけたら、「もしかして救難信号では？」と受け止めると思います。

現在のものは存じませんが、少し以前のボーイスカウトやワンゲル活動などの教本でも、救助要請の出し方として「同じ合図の３回繰り返し」を教えており、具体的には懐中電灯を３回点滅させるとか、布切れを３枚セットでぶら下げておく、などの方法が教えられていました。

なぜこうなっているのかというと、事故に遭って助けを呼びたいときに、正規の信号方法（例えばモールス符号によりＸＸＸやＳＯＳを打つとか）を知っている通信員が死ぬか負傷してしまい、それらを知らない門外漢の人しか動けないという事態は大いにあり得ますが、あまり厳密に合図の方法を決めてしまうとそのような場合に困るからです。
ですので、通信訓練をしたことのない人でも簡単に使用可能な『同様合図の３回反復』とされているわけです。

ですのでご質問への答えとしては、他人が聞いて「３回づつ繰り返されているぞ」と受け止められるような鳴らし方を避けること、ということになります。

メロディーなどは大丈夫かと思いますが、三三七拍子は最初の「三三」のところだけが相手の耳に届いてしまうと、誤解されるかも知れません。。。

ちなみに私自身はホイッスルではなく、無線機の音量を最大に上げるとか、爆竹や紙火薬を鳴らすとか、そんな方法で音を出しています。

水音でこちらの気配が伝わりにくい沢ルートの屈曲点などでは鉢合わせが恐いので５分おき位に「ピッ！ピッ！ピ〜〜！！」と３回ずつ鳴らします。

良くポータブルラジオを鳴らしながら歩く方もおられますが…あまりいただけませんねぇ。
あとは定番の熊鈴でしょうか。２個もぶら下げるとかなり威力？があります（ウルサイ…）

私もメロディーをつけたりしながら吹いてます。