こんにちわ、3年前、同じコースを歩いて折立に下山した者です。
バスの時刻見たらお分かりのように、折立から富山駅行直通バスと有峰駅行バスがあります。有峰行は、予約なしでも乗れましたよ。特に2便目だったからか、お盆の時期でしたが、座席、余裕でした。太郎平小屋でバスの予約の件、尋ねた時、ほとんど乗車できる、と。まあ、予約の人が優先されますが。心配なら太郎平小屋に着いてから予約されたらいいと思いますが…。
折立バス停は、上高地のバス乗り場ほどごった返しません。近くにキャンプ場もあり、静かでいい所でした。

当日のバスに空席がある場合は予約なしでも乗れます。
でも、不確実で心配ですよね。
（去年のパンフレット）
http://www.chitetsu.co.jp/wp-content/uploads/2012/04/p02.pdf

車を立山にデポするのではなく、初日に折立まで入って車をデポし、バスと電車で立山に向かう計画にすれば、不安は無くなるのではないでしょうか。３泊で縦走なら、十分アレンジ可能と思いますが。