フリーのログラム「gpx2jsgi-1.2」で複数のGPXファイルをまとめて、単一の出力ファイルに変換できます（マージ機能）。
このプログラムは、ファイル形式を変換するプログラムですが、出力ファイル指定を入力と同じGPXファイルにすることでファイルをまとめることができます。

避難小屋とかで休憩しますと、GPSが受診できないためロガーのデータが区切れてしまうので、このプログラムを利用しています。

私は普段カシミールで編集しておりますので、カシミールをお持ちであればという前提で説明いたします。
表参道コースと大杉谷コースを各々カシミールにダウンロードし、編集メニューの｢GPSデータ編集｣を選択すると、｢トラック｣の中に表参道コースと大杉谷コースのトラックデータが有る筈です。
どちらのデータを先にするのか判りませんが、表参道の次に大杉谷をジョイントするとの前提で説明します。
表参道のトラックデータをダブルクリックするとトラックデータ編集というウィンドが開きます。一番左端にナンバーの欄が有りますので第１行目で左クリックし末行までスクロールしてシフトキーを押した状態で末行を左クリックし全行をハイライト表示にし、右クリックでコピーを選択します。
これで表参道のトラックデータの中身がクリップボードに保持されます。
表参道のトラックデータ編集を閉じて大杉谷のトラックデータ編集を開きます。
その第１行目で右クリックで貼り付けを選択すれば大杉谷のトラックデータの前に表参道のトラックデータが挿入されます。
新規保存して終了です