こんばんは。ainakarenさん。

・セキュリティソフトによって、どれを有害なCookieに指定するか異なります。（ソフト会社間で、「有害」の統一認定というものがCookieにはありません）おそらく、お使いのセキュリティソフトの対応ブラウザではない（力を入れてない？）から検出数が違うだけです。Cookieはウイルスソフトが検知すべきなのかな？と個人的には思います。危険度が全く違いますし、広告目的のものがほとんどで、神経質にならないほうが良いと思います。広告系に対応されたいなら、Spybotなどを併用されたほうがよいでしょう。無料です。

http://www.safer-networking.org/

・ブラウザの疲弊に関して、お話を見た限りゴミファイルのせいではないかと思います。CCleanerなどで一時ファイルなどを削除してみては。FireFoxのデータベースも最適化されるので、効果が見込めるかもしれません。

http://www.piriform.com/

どちらも英語ですが解説サイトも充実していますから、Googleなどで情報収集してから、利用を検討してみてください。

あいなかさん、こんばんは。
Firefoxが重くなるのですか、僕も前に使っていて同じようなことがあったので今は
Google Chromeを使っています。

ブラウザの再起動はやられているようなので、他に簡単にできるのは
閲覧した履歴を消すことでしょうか。
ブラウザの右上に横3本のメニューボタンがあると思います。
そこから「履歴」をクリックすると「すべての履歴を消去」というウィンドウが出ます。
そこで消去する項目を「表示したページとダウンロードの履歴」「Cookie」「キャッシュ」にチェックを入れて右下の「今すぐ消去」を押してください。
「現在のログイン情報」にチェックが入っていたらそれは外しておいてください。
ヤマレコなどもログインしなおすようになってしまうので。

いま思いつくのはこのぐらいです。
改善されるといいのですが。

ainakaさん、こんばんは。

Windows（に限らず？）、メモリーの管理上の問題で、所謂「メモリーにゴミが溜まる」ことは考えられます。私も普段はPCをシャットダウンせずにスリープを使っていますが、レスポンスが悪くなってくるとリブート（再立ち上げ）を行っています。
疲れたという訳では無いですが、機会も人間も時折リフレッシュするのが良いと思います。

ただ、ご質問の状況として、それほどまでに長時間連続で使用されているとも思いませんので、いろいろ裏でのソフトが走り出しているのではないかと推測します。（この場合、ブラウザで次々にページを見に行かなくても同じ状況になり得ます）
ソフトの更新をやっていないと、繰り返しダウンロードが動いて通信速度を圧迫しているのかも知れません。

Windows Update 等は適宜実施された方が良いと思います。